本網(wǎng)訊 2月6日,《Science》刊發(fā)我校園藝學(xué)院十字花科蔬菜團(tuán)隊(duì)與河北農(nóng)業(yè)大學(xué)趙建軍教授團(tuán)隊(duì)及國(guó)內(nèi)外多家科研機(jī)構(gòu)共同完成題為“Gapless pangenome analyses reveal fast Brassica rapa subspeciation”的研究成果。該研究為達(dá)爾文提出的“被子植物為何能在地球上迅速崛起、并在極短地質(zhì)時(shí)間內(nèi)完成爆發(fā)式多樣化”這一懸而未決的“惱人之謎”提供了新的基因組學(xué)視角:以一棵看似普通的白菜(Brassica rapa)為切入口,系統(tǒng)描繪了“白菜王國(guó)”如何從一個(gè)共同祖先演變?yōu)?/span>“諸侯并立”的多亞種格局,構(gòu)建了一個(gè)將經(jīng)典進(jìn)化問(wèn)題落地到具體作物系統(tǒng)的基因組學(xué)研究范例。

該研究對(duì)1720份不同亞種的白菜材料,其中包含我校園藝學(xué)院十字花科蔬菜團(tuán)隊(duì)301份烏菜種質(zhì)資源,進(jìn)行“人口普查”式的基因組重測(cè)序,精選7個(gè)亞種的11份“諸侯”代表材料,從基因組、泛基因組和泛遺傳學(xué)三個(gè)層面系統(tǒng)刻畫(huà)了白菜亞種快速分化的遺傳基礎(chǔ),把被子植物“快速擴(kuò)張”的經(jīng)典問(wèn)題研究具體落實(shí)到一個(gè)肉眼可見(jiàn)的演化框架之中;通過(guò)構(gòu)建完整著絲粒圖譜,揭示了衛(wèi)星重復(fù)、著絲粒動(dòng)態(tài)與結(jié)構(gòu)變異在蕓薹屬物種演化中的關(guān)鍵作用,加深了對(duì)蕓薹屬基因組起源與分化順序的認(rèn)識(shí)。審稿人認(rèn)為,該工作是Brassica基因組研究領(lǐng)域“一次里程碑式的飛躍”,構(gòu)建的0 gap基因組與泛基因組資源“樹(shù)立了群體基因組學(xué)研究的新標(biāo)桿”,有望成為“蕓薹屬遺傳學(xué)的里程碑工作”。同時(shí)審稿人也指出,這一研究“代表了巨大的工作量,將成為整個(gè)領(lǐng)域的重要資源,對(duì)植物基因組演化和作物表型多樣性的理解具有廣泛而深遠(yuǎn)的影響。

河北農(nóng)業(yè)大學(xué)馬衛(wèi)教授、劉遠(yuǎn)銘副教授、張曉孟副教授,河南省農(nóng)科院蔬菜研究所魏小春研究員,沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)李曉楠教授,蘇州農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所劉照坤研究員,安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)袁凌云教授,廣州市農(nóng)業(yè)農(nóng)村科學(xué)院李光光高級(jí)農(nóng)藝師為該論文的共同第一作者。河北農(nóng)業(yè)大學(xué)趙建軍教授、馬衛(wèi)教授和洪益國(guó)教授,河南省農(nóng)科院蔬菜研究所原玉香研究員,比利時(shí)根特大學(xué)Yves Van de Peer教授為論文的通訊作者。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、安徽省“雙一流”培育學(xué)科等資金項(xiàng)目的支持。(文:王文杰 一審:程玉峰 二審:鄭雪林 三審:曹雷)
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文:王文杰
一審:程玉峰
二審:鄭雪林
三審:曹雷
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